중소기업 M&A 활성화의 전환점

정부의 세법 개정 방향, M&A 활성화 촉진할까?

스타트업 생태계에 미칠 긍정적 효과와 도전 과제

국내외 유사 사례와 향후 정책적 기대

정부의 세법 개정 방향, M&A 활성화 촉진할까?

 

스타트업 창업자와 투자자들이 가장 관심을 갖는 주제 중 하나는 사업의 '엑시트(Exit)'입니다. 사업을 매각하거나 상장하는 방식으로 투자금을 회수하고 새로운 기회를 창출하는 것은 창업 생태계의 필수적인 구성 요소입니다.

 

하지만 한국에서는 스타트업이 이런 엑시트 기회를 충분히 누리지 못한다는 지적이 꾸준히 이어져 왔습니다. 주요한 원인 중 하나로는 M&A(인수·합병) 과정에서의 세금 부담이 지목됩니다.

 

과도한 세금은 기업의 매각과 인수를 둔화시키고, 결과적으로 창업자와 투자자의 의욕을 낮추는 요인이 됩니다. 이를 해결하기 위해 한국 정부가 중소기업과 스타트업의 M&A를 활성화하고 엑시트 기회를 확대하기 위한 세법 개정을 추진하고 있다고 밝혔습니다. 최근 기획재정부는 M&A 과정에서 발생하는 세금 부담을 완화하고, 피인수 기업 주주의 양도차익에 대한 과세를 합리적으로 조정하는 방안을 검토 중이라고 공식 발표했습니다.

 

이는 유니콘(10억 달러 이상의 기업 가치) 기업으로 성장하지 못하더라도 혁신적인 기술을 보유한 스타트업들이 성공적으로 사업을 매각하고 새로운 도전을 할 수 있는 환경을 조성하기 위함입니다.

 

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법 개정이 이루어진다면, 관련 업계는 이번 개정안이 스타트업 생태계와 벤처 투자 시장에 본질적인 변화와 긍정적 영향을 미칠 것으로 보고 있습니다. 과연 중소기업과 스타트업이 직면한 현재의 문제는 어떤 모습일까요?

 

현행 세법은 M&A의 매각 측과 인수 측 모두에게 부담스러운 구조로 설계돼 있습니다. 현재 M&A 관련 세금은 매각 측과 인수 측 모두에게 부담으로 작용하여, 잠재적인 M&A 거래를 저해하는 주요 요인으로 지적되어 왔습니다. 매각자는 양도소득세 부담이 크고, 인수자는 자금 조달 및 세금 문제에서 어려움을 겪습니다.

 

특히 비상장 주식의 경우 양도소득세율이 높아 스타트업 창업자와 초기 투자자의 회수율을 크게 제약합니다. 이는 투자 심리 위축으로 이어지고, 스타트업과 중소기업에 필요한 초기 자금을 유치하는 데에도 부정적인 영향을 미칩니다. 특정 산업에서 인프라가 필요하고 혁신적인 기술을 보유한 기업이 많음에도 불구하고 엑시트 기회를 살리지 못해 경쟁력을 잃게 되는 사례가 이어져 왔습니다.

 

 

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정부는 이러한 문제를 해결하기 위해 구체적인 개선 방안을 마련하고 있습니다. 특히 기술 혁신형 중소기업의 M&A에 대해 세액 공제 범위를 확대하고, 비상장 주식 양도소득세율을 조정하는 등 다양한 인센티브를 제공할 계획입니다.

 

이러한 세법 개정은 벤처 투자 시장의 선순환 구조를 구축하고, 초기 단계 스타트업의 투자를 촉진하는 데 중요한 역할을 할 것으로 기대됩니다. M&A를 통한 엑시트가 활발해지면 벤처 캐피탈은 투자금 회수를 통해 새로운 스타트업에 재투자할 수 있는 여력이 생기기 때문입니다. 전문가들은 정부의 이번 세법 개정이 이러한 문제의 상당 부분을 완화하면서 성장 기회를 확대할 것으로 기대하고 있습니다.

 

업계 관계자들은 M&A 과정에서 세제 혜택을 확대하면 기업 매각의 경제적 실익이 커지고, 기업 인수에 대한 투자 심리도 강화될 것이라는 의견을 제시하고 있습니다. 또한 스타트업 생태계 전문가들은 한국이 여전히 스타트업이 초기 단계에서 투자받기 어렵다는 문제를 안고 있으며, 자금 흐름이 순환되려면 창업자는 매각 기회를 얻고 투자자는 이를 통해 자금을 회수해 새로운 스타트업에 투자할 수 있어야 한다고 지적합니다.

 

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스타트업 생태계에 미칠 긍정적 효과와 도전 과제

 

이번 세법 개정의 가장 중요한 의의는 피인수 기업의 창업자 및 임직원에게는 새로운 기회를 제공하고, 인수 기업에게는 성장 동력을 확보하는 윈-윈(Win-Win) 효과를 가져올 수 있다는 점입니다. 창업자는 그동안 쌓아온 기술과 노하우를 정당하게 평가받고 합리적인 세금 부담 하에 사업을 매각할 수 있게 되며, 이를 통해 새로운 창업이나 다른 기회에 도전할 수 있는 자본을 확보하게 됩니다. 인수 기업 입장에서는 혁신적인 기술과 인력을 확보하여 시장에서의 경쟁력을 강화할 수 있습니다.

 

이러한 선순환 구조가 정착되면 스타트업 생태계 전체가 활성화되고, 더 많은 혁신이 창출될 수 있는 환경이 조성됩니다. 물론, 이번 세법 개정이 모든 문제를 완벽히 해결하는 것은 아닙니다.

 

특히 세율 조정이 주요 논의 사항이기 때문에 정부가 피인수 기업 주주의 양도소득세율을 어느 정도 수준으로 낮출지, 혹은 구체적인 인센티브 제공 방안이 얼마나 효과적일지가 정책의 성공 여부를 가를 것입니다.

 

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또한, 세법 개정 이후 실질적으로 얼마나 많은 기업이 M&A를 선택할지는 시장의 자율적 판단에 달려 있습니다. 한편으로는 세제 혜택 확대가 투자자 중심의 정책으로만 보일 가능성도 있어, 창업자와 인수 기업의 관점을 균형 있게 반영하는 정책 설계가 필요하다는 목소리도 나오고 있습니다.

 

세액 공제 범위 확대와 비상장 주식 양도소득세율 조정이라는 구체적인 방안이 실제로 어떤 형태로 구현될지도 중요한 관전 포인트입니다. 기술 혁신형 중소기업의 범위를 어떻게 정의할 것인지, 세액 공제 비율은 어느 정도가 적정한지, 비상장 주식 양도소득세율을 현행 대비 얼마나 낮출 것인지 등 세부적인 사항들이 정책의 실효성을 결정할 것입니다.

 

이러한 세부 사항들이 시장의 기대에 부응하는 수준으로 설계되지 않는다면, 제도 개선의 효과가 제한적일 수 있습니다.

 

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전문가들은 이번 세법 개정이 한국 스타트업 생태계의 성장 단계를 한 단계 끌어올리는 중요한 전환점이 될 것으로 평가하고 있습니다. 그동안 한국의 스타트업 생태계는 창업과 초기 투자 단계에서는 어느 정도 활성화되었지만, 성장 단계 이후의 엑시트 옵션이 제한적이라는 한계가 있었습니다. IPO(기업공개)는 준비 기간이 길고 까다로운 요건을 충족해야 하며, M&A는 세금 부담 때문에 매력적이지 않은 선택지였습니다.

 

이번 세법 개정이 M&A를 보다 현실적이고 매력적인 엑시트 옵션으로 만든다면, 스타트업 창업자들은 더 다양한 성장 전략을 구사할 수 있게 됩니다. 벤처 투자 시장의 관점에서도 이번 개정안은 중요한 의미를 갖습니다.

 

벤처 캐피탈의 가장 큰 과제는 투자금 회수입니다. 투자금을 성공적으로 회수해야만 펀드 투자자들에게 수익을 돌려주고, 새로운 펀드를 조성하여 다음 세대의 스타트업에 투자할 수 있습니다. 그런데 현재 한국의 상황에서는 IPO 외에는 투자금 회수 방법이 제한적이었습니다.

 

M&A가 활성화되면 벤처 캐피탈은 포트폴리오 기업의 성장 단계와 시장 상황에 따라 IPO와 M&A 중 최적의 엑시트 전략을 선택할 수 있게 되어, 투자 효율성이 크게 높아질 것입니다.

 

국내외 유사 사례와 향후 정책적 기대

 

향후 이번 세법 개정을 계기로 중소기업과 스타트업의 엑시트 환경이 얼마나 개선될지가 중요한 관전 포인트가 될 것입니다. 벤처 투자 시장의 선순환 구조를 만들기 위해 정부와 민간이 협력하려는 의지가 중요하며, 세제 혜택 외에도 금융·행정적 지원책이 종합적으로 마련되어야 합니다. 특히, 기술 혁신형 중소기업이 M&A를 통해 빠르게 시장의 주도권을 확보할 수 있도록 법적·제도적 발판을 제공하는 것이 핵심 과제가 될 것입니다.

 

전문가들은 이번 개정이 단순히 세금을 낮추는 것을 넘어, 기업 간의 윈윈(Win-Win) 효과를 창출하는 방향으로 설계되길 기대하고 있습니다. 실제로 M&A 시장이 활성화되면 산업 전반에 긍정적인 파급 효과가 예상됩니다. 대기업이나 중견기업은 혁신적인 기술을 보유한 스타트업을 인수함으로써 신사업 진출이나 기술 고도화를 빠르게 달성할 수 있습니다.

 

스타트업은 대기업의 자본력과 시장 네트워크를 활용하여 기술을 상용화하고 시장을 확대할 수 있습니다. 이러한 상생 구조가 자리 잡으면 한국 경제 전체의 혁신 역량이 강화되고, 글로벌 경쟁력도 높아질 것입니다. 마지막으로 독자들에게 묻고 싶습니다.

 

우리는 혁신을 지원하고, 창업을 더욱 활성화할 수 있는 환경을 조성하기 위해 무엇을 더 할 수 있을까요? 법과 제도가 열어주는 기회를 통해, 과연 한국의 스타트업 생태계는 글로벌 경쟁력의 중심으로 부상할 수 있을까요?

 

이 질문에 대한 답은 결국 우리 모두가 함께 만들어가야 할 미래라고 하겠습니다. 정부의 정책 개선과 함께 민간 부문의 적극적인 참여, 창업자들의 도전 정신, 투자자들의 장기적 안목이 결합될 때 비로소 한국 스타트업 생태계는 지속 가능한 성장 궤도에 오를 수 있을 것입니다.

 

[알림] 본 기사는 법률·규제 관련 정보를 제공하기 위한 것으로, 법률적 자문을 대체할 수 없습니다. 실제 법적 문제가 있을 경우 반드시 변호사 등 법률 전문가와 상담하시기 바랍니다.

 

 

 

서동민 기자

 

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[참고자료]

hankyung.com

작성 2026.04.07 14:10 수정 2026.04.07 14:10

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